MOPT dedica-se à investigação de base aplicada nos domínios do ordenamento e planeamento territorial. Constituem o MOPT, um grupo de investigadores residentes, com graduação e pós-graduação, em geografia, destacando-se a geografia humana e o planeamento regional e urbano, a modelação espacial e os sistemas de informação geográfica. Nos últimos anos, os seus investigadores têm participado em vários estudos e projectos nacionais e internacionais, nomeadamente no diagnóstico das tendências de organização do território nacional e europeu; na elaboração de estudos, planos e programas nos domínios do ordenamento do território e do urbanismo; na construção de cenários de ordenamento e de desenvolvimento territorial.
Presentemente os membros do MOPT participam em projectos de investigação sobre a sustentabilidade da forma urbana (FURBS), modelos de alteração de usos de solo em áreas urbanas (LUCMODEL), as condições de transformações de ecossistemas e o desenvolvimento de processos epidemiológicos (EDEN); o desenvolvimento da sociedade da informação (eATLAS). Para além do desenvolvimento de projectos de investigação, os membros do MOPT desenvolvem actividades de consultoria nos domínios do ordenamento e do planeamento territorial, de onde se destaca a participação na elaboração do Programa Nacional da Política de Ordenamento do Território (PNPOT), o Estudo do Rísco Sísmico e de Tsunamis do Algarve (ERSTA), o Plano Regional de Ordenamento do Território do Oeste e Vale do Tejo (PROT OVT) e o Plano Regional de Ordenamento do Território da Área Metropolitana de Lisboa (PROT AML).
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